A colonização da área que hoje constitui o município de Salvador das Missões, foi iniciada em 1906, por famílias de origem germânica. Pertencia inicialmente ao município de São Luiz Gonzaga, e depois ao município de Cerro Largo. Em 1963 foi criado o Distrito de Salvador das Missões e em 1992 houve a emancipação.
Salvador das Missões está localizada a 505 Km da capital Porto Alegre.