O istmo entre a Laguna dos Patos e o Oceano Atlântico foi habitado em seus primórdios pelos índios carijós. Em 1742, já existia um Posto de Vigilância denominado Guarda de Mostardas. A freguesia foi criada através do Alvará datado de 18 de janeiro de 1773, sob denominação de São Luiz, Rei da França. O município é criado em 26 de dezembro de 1963.
Mostardas está localizada a 188 Km da capital Porto Alegre.